1. septembril 1997. aastal loodi Saksakeelne osakond, avamisel viibis ka tollane Eesti Vabariigi president Lennart Meri.

Kooli toetab saksa poolelt esmajoones Kölni Väliskooliasjanduse Keskus, kes on saatnud Eestisse saksa õpetajad. Keskus nõustab osakonda kõikides pedagoogilistes ja majanduslikes küsimustes, lisaks sellele kannab ka saksa õpetajate koolituskulud.  Täienduskoolitus toimub koos teiste riikide saksakeelsete osakondade õpetajatega – Rumeeniast Bukaresti vöi Temesvari, Bulgaariast Sofia, Slovakkiast Popradi, Tsehhist Praha vöi Libereci ning Ungarist Baja kolleegidega. Küpsuseksamite ja õppeplaanide eest on vastutav Kultuuriministrite Konverents, sealt suunatakse kooli ka saksa eksamikomisjoni esimees.

Palju aastaid on tehtud edukat koostööd Saksa Kultuuriinstituudi/ Goethe Instituudi ja Robert Boschi Fondiga.

Saksakeelse osakonna õpilasi valmistatakse ette saksa ja eesti abituuriumiks, seetöttu õpetatakse osa aineid saksa, osa eesti keeles. Saksa keeles toimub õppetöö saksa õppeplaanide järgi saksa õpetajate juhendamisel ainetes saksa keel, ajalugu, matemaatika, füüsika, keemia ja bioloogia.

Gümnaasiumi lõpetamisel saavad õpilased kaks lõputunnistust: saksa  abituuriumi lõputunnistuse, mis annab õiguse edasisteks õpinguteks Saksamaa kõrgkoolides ning eesti lõputunnistuse. Lõpueksamid toimuvad Eesti Vabariigi ja Saksa Liitvabariigi poolt välja töötatud eksamikorralduse põhjal. Saksa abituuriumi eksamiained saksa keel ja matemaatika kehtivad eesti riigieksamina, emakeele riigieksam kehtib saksa lõpueksamina.

Saksakeelse osakonna klassides on klassijuhatajateks nii eesti kui saksa õpetaja.

Saksakeelne osakond on avatud kõikidele Tallinna Saksa Gümnaasiumi ning teiste koolide õpilastele. Vastuvõtul kõikidesse klassidesse on määravaks eesti keele, saksa keele, inglise keele, matemaatika, bioloogia ja ajaloo keskmine hinne ning vestlus. Osakond sobib õpilastele, kes tunnevad huvi saksa keele ja reaal- ning loodusteaduslike ainete vastu. Saksakeelne osakond on orienteeritud lõimuva Euroopa keeleoskuse ja elu- ning töönõuetele, mille juures just nimetatud ainetel on täita kaalukas osa. Tallinna Saksa Gümnaasiumi Saksakeelne osakond on seega Euroopa tulevikumudeliks, kus on oluliseks koostöö kõikides ainevaldkondades ühise eesmärgi saavutamisel, üksteise austamine ja mõistmine.